Rapport scientifique, 7 décembre 2021

Actuellement, le nombre de cas déclarés de SARS-CoV-2 en Suisse augmente d’environ 16%, le taux d’occupation des unités de soins intensifs d’environ 20% et le nombre de décès d’environ 40% par semaine. L’estimation du nombre quotidien d’hospitalisations, dans le cas présent, n’est pas fiable en raison des décalages temporels de notification; l’augmentation réelle est très probablement sous-estimée. Le taux de positivité, actuellement de 15,6%, dénote un nombre élevé de cas d’infections non signalés. L’épidémie en Suisse est dominée par la variante Delta depuis fin juin 2021. Le variant Omicron, que l’OMS a classé comme préoccupant le 26.11.2021, a été détecté à plusieurs reprises en Suisse ces dernières semaines.

Alors qu’en Suisse, les infections continuent d’augmenter, en Allemagne et en Autriche le nombre de cas signalés diminue. De mi-octobre à mi-novembre, la situation épidémiologique en Suisse a évolué de manière similaire à celle de l’Autriche et de l’Allemagne, avec un décalage temporel d’environ 3 à 5 semaines par rapport à l’Autriche et – en ce qui concerne le nombre de cas – sans décalage temporel par rapport à l’Allemagne. L’Autriche et l’Allemagne, qui ont mis en place des mesures rigoureuses pour réduire les contacts, constatent maintenant un recul du nombre des nouveaux cas notifiés (section 1 ci-dessous). En Suisse, le nombre d’infections signalées continue d’augmenter. Les effets des mesures prises le 6.12.2021 se manifesteront à partir de la semaine du 13.12.2021 dans les chiffres concernant les cas confirmés.

Cette évolution épidémiologique comporte un risque élevé de dépassement des seuils critiques en ce qui concerne l’occupation des lits en soins intensifs. Sur la base de l’évolution du nombre de cas, il est possible d’établir une projection sur le nombre de patientes et patients COVID-19 nécessitant des soins intensifs pour les semaines à venir. Normalement, un nombre jusqu’à 200 patientes et patients COVID-19 occupant les unités de soins intensifs est maîtrisable^[1]. Ce seuil a été franchi fin novembre 2021^[2]. Si le nombre d’infections continue de croître au rythme actuellement observé, on s’attend à ce que les patientes et patients COVID-19 nécessitant des soins intensifs dépassent le nombre critique de 300 puis 400 en décembre, continuant de croître sans relâche (figure 2). Si le seuil de 300 patientes et patients COVID-19 hospitalisés dans les unités de soins intensifs est dépassé, il faut s’attendre à un report des interventions dans toute la Suisse et, au niveau local, à un triage possiblement silencieux^[3]. Si le seuil de 400 patientes et patients COVID-19 hospitalisés dans les unités de soins intensifs est dépassé, cela signifie que les capacités des USI sont épuisées dans toute la Suisse, et on s’attend à un triage à grande échelle, et éventuellement silencieux^[4].

Les données de l’automne et de l’hiver 2020-21 montrent que la qualité du traitement médical peut diminuer considérablement dans une telle situation, et que cela peut entraîner une augmentation de la mortalité . Durant l’automne et l’hiver 2020/21, la forte charge de travail qui a pesé sur les hôpitaux et les unités de soins intensifs a entraîné le report d’environ 19 000 opérations, ce qui a affecté le traitement médical des patientes et patients non COVID-19^[5]. Dans le même temps, la proportion de patientes et patients COVID-19 ayant reçu des soins intensifs lors d’une hospitalisation a été divisée par deux^[6]. Cela indique qu’un triage silencieux a eu lieu lors de l’accès au traitement intensif et que la qualité du traitement des patientes et patients atteints de COVID-19 a dû être nettement réd e en raison de la pression élevée qui pèse sur les hôpitaux. Des études menées en Suisse montrent que plus les unités de soins intensifs sont occupées, plus la mortalité des patientes et patients hospitalisés atteints de COVID-19 augmente^[7], et que leur mortalité dans les unités de soins intermédiaires et intensifs est plus élevée durant la période de l’automne-hiver 2020/21 qu’au printemps 2020 ^[8]. Ces analyses permettent de constater qu’une surcharge du système de santé, comme ce fut le cas à l’automne et à l’hiver 2020/21, a des conséquences négatives directes pour un grand nombre de patientes et patients.

En raison du nombre encore élevé de personnes non immunisées en Suisse, la vague épidémique actuelle peut largement excéder les capacités hospitalières du pays. Actuellement, environ 900 000 personnes en Suisse ne sont ni vaccinées ni immunisées par guérison d’une infection (sur la base de ^[9], mis à jour). En outre, la protection contre l’hospitalisation a également quelque peu diminué chez une partie des personnes vaccinées, en particulier dans les classes d’âge plus élevées, qui ont été vaccinées il y a plus de six mois. Dans le cas le plus défavorable, si la plupart de ces personnes étaient infectées au lieu de se faire vacciner ou, selon le cas, de recevoir une troisième dose de vaccin, environ 20 000 à 40 000 hospitalisations supplémentaires seraient à prévoir (sur la base des chiffres du 23.11.2021;¹). Ce chiffre est du même ordre de grandeur que le nombre total d’hospitalisations enregistré depuis le début de la pandémie (le nombre total d’hospitalisations jusqu’à présent s’élevait à environ 36 000^[10] ; une étude allemande ^[11] donne des estimations similaires). Près de la moitié (16 000) des hospitalisations à ce jour se sont produites en l’espace de trois mois, entre mi-octobre 2020 et mi-janvier 2021 ^[12]. Comme nous l’avons mentionné plus haut, au cours de cette période la qualité des traitements a significativement subi les conséquences de la pression qu’a connu le système de santé. Si une grande partie des 20 000 à 40 000 hospitalisations supplémentaires maximales attendues se produisait en l’espace de quelques mois, la charge du système de santé pourrait être à peu près aussi considérable, voire plus encore, que le pic actuel, et les effets négatifs sur les traitements pourraient ainsi être tout aussi importants, si ce n’est plus important encore qu’en automne et hiver 2021-22.

Afin d’éviter une surcharge importante des unités de soins intensifs, il est nécessaire que les contaminations par le SARS-CoV-2 soient réduites fortement et dans les meilleurs délais. Avec un taux de reproduction réduit à 0,8 dès le 6 décembre 2021, on pourrait s’attendre à ce que l’occupation des unités de soins intensifs augmente encore pendant environ deux semaines et que le seuil critique de 300, voire 400, patientes et patients COVID-19 nécessitant des soins intensifs soit dépassé. Un Re de 0,8 correspond à la situation actuelle en Autriche avec des mesures d’endiguement très strictes (fig. 2). Si par contre l’on ne parvient que plus tard à réduire le nombre des contaminations, ou que cette réduction est moins importante qu’espéré, le seuil critique pour le système de santé suisse sera vraisemblablement plus largement et plus longuement dépassé. Ainsi, plus la réduction de Re est importante, plus elle sera en mesure d’enrayer la progression attendue du nombre de patientes et patients COVID-19 nécessitant des soins intensifs. Par exemple, si Re est réduit à 0,7 le 11 décembre 2021, il subsiste un risque de dépasser le seuil critique de 400 patientes et patients COVID-19 nécessitant des soins intensifs, mais le pic attendu serait moins élevé et de plus courte durée qu’avec une plus faible réduction des infections. Comparé à l’estimation la plus récente du Re de 1,19 (IC 95% : 1,04-1,33), qui reflète les infections au 26.11.2021, une réduction à 0,8 du Re correspond à une situation où il faudrait éviter environ un tiers des contacts infectieux par rapport à la situation de fin novembre.

Une réduction des hospitalisations appelle une diminution des contacts, en particulier des contacts à haut risque de transmission et des contacts entre personnes non protégées contre les évolutions graves de la maladie. Les moyens efficaces pour réduire les contaminations ont déjà été discutés à plusieurs reprises (par ex. section 3.1 ^[13]). Une réduction des contacts à l’intérieur et des contacts avec des personnes qui ne bénéficient pas d’une protection immunitaire élevée contre les complications grâce à la vaccination ou à la guérison est particulièrement efficace. Pour éviter les contaminations, il est judicieux de combiner des mesures telles que le port de masques, la distanciation, une bonne ventilation, les certificats et les tests faits régulièrement. Compte tenu de l’incidence élevée actuelle, le risque que les manifestations dites «3G» entraînent des contaminations est important : en effet, comme une partie des personnes participant aux manifestations 3 G (vaccinées, guéries, testées négatives) n’est pas immunisée, il existe un risque de contamination et de contagion conduisant à une évolution grave de la maladie. Ce risque peut être réduit par l’obligation de porter un masque en permanence et par d’autres concepts de protection, malgré la règle des 3G, ou par des manifestations n’impliquant que des personnes vaccinées ou guéries (2G). En raison de la diminution de l’efficacité de la vaccination et de la circulation actuellement très élevée du virus, des infections se produisent également parmi les personnes vaccinées et guéries (section 1 ci-dessous). Lors de grandes manifestations 2G en intérieur avec des activités à risque et sans possibilité de port de masque, une obligation générale de test pour tous ceux et celles qui n’ont pas encore reçu de troisième dose de vaccin permettrait de réduire encore le risque de transmission.

Une réduction significative et rapide du nombre de cas implique également l’application de mesures visant à réduire les transmissions chez les enfants et les adolescents. C’est dans les groupes d’âge qui n’ont pas encore eu accès à la vaccination (moins de 12 ans) ou dans ceux qui présentent la couverture vaccinale la plus faible de tous les groupes d’âge ayant accès à la vaccination (12-19 ans ; ^[14]) que l’incidence des nouvelles infections par le virus Delta est la plus élevée. Ces jeunes personnes ont énormément de contacts entre eux à l’école et lors des loisirs, mais aussi des contacts très étroits avec leurs parents et parfois leurs grands-parents, mêlant les différentes générations. Les derniers mois ont montré qu’en Suisse, les mesures prises jusqu’à présent n’ont pas suffi pour contrôler l’incidence dans ces groupes d’âge^[14]. Avec le variant Delta, les chaînes de transmission occasionnées par des enfants sont désormais plus fréquentes^[14]. Alors que ces derniers ne subissent que très rarement des évolutions graves de la maladie, chez les adultes contaminés, il en va de même seulement s’ils sont vaccinés et que la dernière vaccination remonte à moins de six mois. Une révision des concepts de protection dans les écoles, les structures d’accueil et les activités de loisirs organisées permet de les adapter à la transmissibilité accrue du variant Delta. Davantage de distanciation, une obligation élargie de porter un masque, une aération régulière à l’aide de capteurs de CO₂ et une généralisation des tests répétitifs avec une fréquence accrue (au moins 2 fois par semaine) et un retour rapide des résultats sont les mesures les moins restrictives pour atteindre cet objectif. Les vacances scolaires qui approchent offrent une occasion de revoir les concepts de protection. Pendant les vacances de Noël, le risque de contagion dans la famille élargie est plus élevé en raison des contacts étroits et intergénérationnels. Procéder au préalable à un rappel de la protection vaccinale des parents et des grands-parents réduit le risque de contagion et de maladie.

En plus de la réduction des contacts, la prompte mise en place d’une vaste couverture vaccinale contribue également à protéger la santé de chacun, ainsi que le système sanitaire. Si la plupart des personnes doublement vaccinées recevaient une troisième dose de vaccin avant d’être infectées, cela permettrait, en Suisse, d’éviter environ 10 000 à 20 000 hospitalisations chez les personnes de plus de 70 ans (sur la base des données du 23.11.2021;^[1]). L’urgence de ces troisièmes vaccinations est illustrée par la figure 2 dans¹ : la proportion de personnes doublement vaccinées et hospitalisées a augmenté ces dernières semaines sans que la couverture vaccinale ait progressé de manière significative. La double vaccination de toutes les personnes non encore vaccinées avant qu’elles ne soient infectées réduit également la charge de morbidité de 10 000 à 20 000 hospitalisations (selon les données du 23.11.2021;^[1]). Si seule une partie des troisièmes ou, selon le cas, des premières et deuxièmes vaccinations peut être administrée, la réduction attendue des hospitalisations est d’autant plus faible. Pour que la campagne de troisième vaccination puisse enrayer sensiblement la vague épidémique actuelle, il faudrait que, chaque jour, environ 1% de la population en Suisse reçoive le booster ^[1],^[15].

Il est important de réduire fortement et au plus vite le nombre de nouvelles infections – et ainsi de ralentir la vague épidémique en Suisse –, et ce pour plusieurs raisons. Premièrement, c’est une condition nécessaire pour éviter une surcharge importante et prolongée du système de santé suisse. Deuxièmement, cela permet à la population de Suisse de se vacciner avec une troisième dose avant d’être infectée, et donc d’être beaucoup mieux protégée contre la maladie et l’hospitalisation. Troisièmement, pour la Suisse cela signifie que le nombre de maladies et d’hospitalisations attendues n’est pas simplement retardé, mais réduit durablement. Quatrièmement, cela augmente la probabilité que l’enseignement puisse se dérouler normalement et donne aux enfants qui le souhaitent la possibilité de se faire vacciner avant d’être infectés. Enfin, une réduction des contaminations mettrait la Suisse dans une meilleure position pour réagir à l’évolution rapide de la situation avec Omicron, par exemple en libérant des capacités hospitalières, des capacités de dépistage et des capacités de traçage des contacts.