Évaluation de la situation épidémiologique, 15 février 2021

Situation générale

Dynamique

À l’échelle nationale, l’épidémie de SARS-CoV-2 montre une tendance à la baisse pour la première quinzaine de janvier. Les estimations du taux de reproduction effectif R_e sont de ¹:

0,95 (intervalle de confiance de 95% IC : 0,81-1,09) sur la base des cas confirmés, au 05.02.2021.
0,79 (95% IC : 0,64-0,95) sur la base des hospitalisations, au 31.01.2021. Pour une comparaison sur la base des cas confirmés, le R_e est estimé à 0,92 (95% IC : 0,83-1,04) pour le même jour.
0,71 (95% IC : 0,5-0,92) sur la base des décès (au 24.01.2021) Pour une comparaison sur la base des hospitalisations, le R_e est estimé à 0,88 (95% IC : 0,78-1,01) pour le même jour. Pour une comparaison sur la base des cas confirmés, le R_e est estimé à 0,87 (95% IC : 0,74-1) pour le même jour.

Les estimations pourraient être rectifiées en raison des décalages temporels des notifications et des fluctuations dans les données. Nous soulignons que les valeurs de R_e reflètent les événements d’infection survenus il y a 10 jours à plusieurs semaines en raison du délai entre l’infection et l’apparition d’un événement (confirmation du cas, hospitalisations, décès). Une observation des sept grandes régions de Suisse montre que les tendances y sont stables, voire en baisse. Cette analyse est étayée par la période de doublement ou de division par deux des cas confirmés, des hospitalisations et des décès au cours des 14 derniers jours ². Le nombre des cas confirmés a baissé de -24% (IC : -14% à -33%) par semaine, le nombre d’hospitalisations de -26% (IC : -16% à -36%) et le nombre de décès de -32% (IC : -17% à -44%). Ces valeurs reflètent les infections survenues il y a plusieurs semaines.

Chiffres absolus

Le nombre cumulé de cas confirmés au cours des 14 derniers jours est de 214 pour 100 000 habitants. La positivité est de 6,9% (au 14.02.2021, avec une tendance à la baisse ; le R_e basé sur la positivité au 05.02.2021 est de 0,78 (95% IC : 0,63-0,94)). Le nombre de patients COVID-19 dans les unités de soins intensifs s’est situé, au cours des 14 derniers jours, entre 220 et 270 ³ personnes (la variation était de -9% (IC :-3% à -15%) par semaine). Le nombre de décès au cours des 14 derniers jours s’est situé entre 15 et 36 ⁴ par jour. Depuis le 1er octobre 2020, l’Office fédéral de la santé publique a enregistré 7’246 décès confirmés en laboratoire.⁵ Les cantons ont fait état de 7’856 décès pendant cette même période. ⁶ Les statistiques de mortalité de l’Office fédéral de la statistique montrent une surmortalité dans le groupe d’âge des 65 ans et plus depuis la 43e semaine de 2020. ⁷

Nouvelles variantes

En Suisse, les variantes B.1.1.7 et B.1.351, initialement décrites au Royaume-Uni et en Afrique du Sud, ont été identifiées pour la première fois au cours de la 51e semaine de 2020. La variante P.1 décrite à l’origine au Brésil a été identifiée pour la première fois au cours de la sixième semaine de 2021. Les analyses épidémiologiques et les données de traçage des contacts indiquent que ces variantes ont un taux de transmission plus élevé que les souches de SARS-CoV-2 connues précédemment ⁸. La caractérisation génétique d’échantillons aléatoires provenant de personnes testées positives en laboratoire, ainsi que la caractérisation génétique systématique des échantillons dans le laboratoire de référence à Genève, permet de suivre dans le temps la fréquence des infections par ces variantes en Suisse. La proportion d’infections par la variante B.1.1.7 par rapport à l’ensemble des infections n’a cessé d’augmenter depuis la première détection. Au cours de la cinquième semaine de 2021 (dès le 01.02.2021), la fréquence du B.1.1.7 en Suisse a été estimée à environ 24% (intervalle de confiance de 95 % : 22% à 27% ; reflétant l’incidence de l’infection environ 10 jours plus tôt ⁹) Ceci est une traduction du texte « Epidemiologische Lagebeurteilung » portant la même date. Seul l’original en allemand fait foi.

Liens:

[1] https://sciencetaskforce.ch/fr/taux-de-reproduction/ et https://ibz-shiny.ethz.ch/covid-19-re-international/: Les estimations de R_eau cours des derniers jours peuvent être sujettes à de légères fluctuations. Elles se produisent en particulier dans les petites régions, lors d’une dynamique changeante ou avec un faible nombre de cas.

[2] https://ibz-shiny.ethz.ch/covidDashboard/trends: Les nombres de cas confirmés et d’hospitalisations/décès des 3 et 5 derniers jours respectivement ne sont pas pris en compte en raison des décalages temporels de notification.

[3] https://icumonitoring.ch

[4] https://www.covid19.admin.ch

[5] https://www.covid19.admin.ch

[6] https://github.com/openZH/covid_19 et https://github.com/daenuprobst/covid19-cases-switzerland

[7] https://www.bfs.admin.ch/bfs/fr/home/statistiques/sante/etat-sante/mortalite-causes-deces.html

[8] https://sciencetaskforce.ch/fr/rapport-scientifique-9-janvier-2021/

[9] https://sciencetaskforce.ch/fr/nextstrain-analyses-phylogenetiques/