Évaluation de la situation épidémiologique, 26 juillet 2021

Depuis la semaine 26, Delta est le variant viral dominant en Suisse. Au cours de la semaine civile 28, la fréquence de Delta était de 96%.

En mars 2021, Alpha devenait la variante dominante du virus en Suisse^[6],^[7], dont le taux de transmission est environ 50% plus élevé que celui du type naturel^[8],^[9],^[10].     Les vaccins à ARNm utilisés en Suisse sont très efficaces contre Alpha ^[11],^[12],^[13].

Les variantes Bêta (B.1.351) et Gamma (P.1), qui ont été détectées pour la première fois en Suisse au premier trimestre 2021, ont été relevées à une fréquence de 0,1% et de 0,5% respectivement sur les 14 derniers jours^[14].

Delta, soit la variante décrite à l’origine en Inde et classée comme «variante préoccupante (VOC, pour Variant of concern)» par Public Health England, est désormais la variante dominante en Suisse. Delta avait une fréquence de 67% au cours de la semaine 26, de 85% au cours de la semaine 27 et une fréquence de 96% au cours de la semaine 28 parmi les cas séquencés ^[15]. En raison des décalages temporels dans l’enregistrement des séquences, ces fréquences peuvent encore changer, notamment au cours de la semaine 28. À partir de cette augmentation de la fréquence du variant Delta, on peut calculer un avantage de transmission par rapport au variant Alpha de 67-75%^[16].

Le variant Delta domine désormais l’épidémie dans de nombreux pays, dont le la Grande-Bretagne^[17], les États-Unis d’Amérique, la France, l’Allemagne, l’Italie et le Portugal^[18]; l’avantage de transmission de Delta par rapport à Alpha a été estimé à 56% (intervalle de confiance de 95%: 34%-81%) dans une étude de l’Université de Warwick incluse dans une prépublication^[19]. Selon une prépublication canadienne^[20] et une étude écossaise^[21] , le taux d’hospitalisation de lié au variant Delta est accru de 74% -85% par rapport à Alpha. Selon une prépublication de Public Health England^[22], la protection vaccinale contre le variant Delta est réduite: après l’injection de la première dose de BNT162b2, l’efficacité contre ce variant n’est que d’environ 34% (au lieu de 51% contre le variant Alpha); après l’inoculation de la deuxième dose, l’efficacité est de 88% (au lieu de 93% contre Alpha).  En Grande-Bretagne, le nombre de cas est à nouveau en hausse depuis des semaines; il en va de même, avec un certain décalage temporel, pour le nombre d’admissions à l’hôpital.^[23]. Dans les pays voisins tout comme en Suisse, le renversement de tendance vers une augmentation du nombre de cas a eu lieu pendant la seconde quinzaine de juin. La prédominance du variant Delta ainsi que l’augmentation du nombre de contacts font courir le risque d’une nouvelle augmentation significative du nombre de cas au cours des prochaines semaines en Suisse. Nous prévoyons aussi, prochainement, une augmentation des hospitalisations, qui devrait toucher une plus grande partie des personnes infectées en raison de la couverture vaccinale plus faible en Suisse qu’au Royaume-Uni^[24].