Évaluation de la situation épidémiologique, 25 janvier 2021

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Situation générale

Dynamique

À l’échelle nationale, l’épidémie de SARS-CoV-2 montre une tendance à la baisse pour le début du mois de janvier, et une tendance stable ou légèrement en baisse pour la mi-janvier. Les estimations du taux de reproduction effectif R_e sont de¹:

0,93 (intervalle de confiance de 95 % IC : 0,79-1,08) sur la base des cas confirmés (au 15.01.2021).
0,65 (95 % IC : 0,48-0,83) sur la base des hospitalisations (au 10.01.2021). Pour une comparaison sur la base des cas confirmés, le R_e est estimé à 0,93 (95 % IC : 0,82-1,04) pour le même jour.
0,84 (95 % IC : 0,68-1,02) sur la base des décès (au 03.01.2021). Pour une comparaison sur la base des hospitalisations, le R_e est estimé à 0,77 (95 % IC : 0,67-0,87) pour le même jour. Pour une comparaison sur la base des cas confirmés, le R_e est estimé à 0,85 (95 % IC : 0,75-0,95) pour le même jour.

Les estimations pourraient être rectifiées en raison des délais de présentation d’une notification et de fluctuations dans les données. Nous soulignons que les valeurs de R_e reflètent les événements d’infection survenus il y a 10 jours à plusieurs semaines en raison du délai entre l’infection et l’apparition d’un événement (confirmation du cas, hospitalisations, décès). Une observation des sept grandes régions de Suisse montre que les tendances y sont stables, voire en baisse. Cette analyse est étayée par la période de doublement ou de division par deux des cas confirmés, des hospitalisations et des décès au cours des 14 derniers jours.² Le nombre des cas confirmés a changé de -20 % (IC : -9 % à -30 %) par semaine, le nombre d’hospitalisations de -35 % (IC : -27 % à -41 %) et le nombre de décès de -17 % (IC : -4 % à -28 %). Ces valeurs reflètent les événements d’infection survenus il y a plusieurs semaines.

Chiffres absolus

Le nombre cumulé de cas confirmés au cours des 14 derniers jours est de 347 pour 100 000 habitants. La positivité est de 0,11 (au 24.01.2021, avec une tendance à la baisse ; le R_e basé sur la positivité au 15.01.2021 est de 0,81 (95 % IC : 0,69-0,93)). Le nombre de patients COVID-19 dans les unités de soins intensifs s’est situé, au cours des 14 derniers jours, entre 310 et 380³ personnes (la variation était de -12% (IC : 7% à -16%) par semaine). Le nombre de décès au cours des 14 derniers jours s’est situé entre 32 et 61⁴ par jour. Depuis le 1er octobre 2020, l’Office fédéral de la santé publique a enregistré 6’609 décès confirmés en laboratoire.⁵ Les cantons ont fait état de 7’210 décès pendant cette même période.⁶ Les statistiques de mortalité de l’Office fédéral de la statistique montrent une nette surmortalité dans le groupe d’âge des 65 ans depuis la 43e semaine de 2020.⁷ Cette surmortalité est évidente dans toutes les grandes régions de Suisse, à l’exception de la région lémanique.⁸

Nouvelles variantes

En Suisse, les variantes B.1.1.7 et 501.V2, initialement décrites au Royaume-Uni et en Afrique du Sud, ont été identifiées pour la première fois au cours de la 51e semaine de 2020. Les analyses épidémiologiques et les données de recherche des contacts indiquent que ces variantes ont un taux de transmission plus élevé que les souches de SARS-CoV-2 connues précédemment ⁹. La caractérisation génétique d’échantillons aléatoires provenant de personnes testées positives en laboratoire, ainsi que la caractérisation génétique systématique des échantillons dans le laboratoire de référence à Genève, permet de suivre dans le temps la fréquence des infections par ces variantes en Suisse. La proportion de ces variantes par rapport à l’ensemble des infections n’a cessé d’augmenter depuis la première détection. Au cours de la troisième semaine de 2021 (dès le 18.01.2021), l’incidence du B.1.1.7 en Suisse a été estimée à environ 10% (intervalle de confiance de 95 % : 8% à 12% ; reflétant l’incidence de l’infection environ 10 jours plus tôt¹⁰)

Liens:

[1] https://sciencetaskforce.ch/reproduktionszahl/ et https://ibz-shiny.ethz.ch/covid-19-re-international/: Les estimations de R_eau cours des derniers jours peuvent être sujettes à de légères fluctuations. Elles se produisent en particulier dans les petites régions, lors d’une dynamique changeante ou avec un nombre de cas bas. En raison de la méthodologie utilisée, l’incertitude réelle entourant les estimations ne peut pas toujours être pleinement représentée.

[2] https://ibz-shiny.ethz.ch/covidDashboard/trends: Les nombres de cas confirmés et d’hospitalisations/décès ne sont pas pris en compte les 3 et 5 derniers jours en raison des délais de présentation d’une notification.

[3] https://icumonitoring.ch

[4] https://www.covid19.admin.ch

[5] https://www.covid19.admin.ch

[6] https://github.com/openZH/covid_19 und https://github.com/daenuprobst/covid19-cases-switzerland

[7] https://www.bfs.admin.ch/bfs/de/home/statistiken/gesundheit/gesundheitszustand/sterblichkeit-todesursachen.html

[8] https://www.experimental.bfs.admin.ch/expstat/de/home/innovative-methoden/momo.html

[9] https://sciencetaskforce.ch/wp-content/uploads/2021/01/Wissenschaftliches_Update14Jan21-DE-1.pdf

[10] https://sciencetaskforce.ch/nextstrain-phylogentische-analysen/